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环境因子对雉鸡甘肃亚种种群遗传多样性的影响
Effects of environmental factors on the population genetic diversity in Strauch’s pheasant (Phasianus colchicus strauchi)
曲江勇,刘迺发
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DOI:
作者单位:琼州学院生物科学与技术学院,海南省两栖爬行动物重点实验室 兰州大学生命科学学院动物所
中文关键字:雉鸡甘肃亚种;线粒体DNA;遗传多样性;环境因子
英文关键字:Phasianus colchicus strauchi, Mitochondrial DNA, Genetic diversity, Environmental factors
中文摘要:采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了雉鸡甘肃亚种9个种群118个样本的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)1150个碱基长度的基因序列,43个变异位点产生51个单倍型。环境因子与种群遗传变异的相关性研究表明,序列变异与经度(r = 0.725,P < 0.05)、年平均温度(r = 0.833,P < 0.05)呈现显著的正相关关系,核苷酸多样性与经度(r = 0.686, P < 0.05)、年平均温度(r = 0.844, P < 0.05)呈现显著的正相关关系。片段化与低温是导致雉鸡甘肃亚种遗传多样性的主要因素。序列变异及核苷酸多样性与温度的变异系数呈现显著的负相关关系(r序列 = -0.679, P < 0.05; r核苷酸 = -0.669, P < 0.05)。温度越稳定地区,雉鸡甘肃亚种的遗传多样性越高。
英文摘要:We used polymerase chain reaction and direct sequencing methods to investigate the relationship between environmental factors and population genetic variability of Strauch’s pheasant (Phasianus colchicus strauchi). A total of 1150 nucleotides of mitochondrial DNA control region were sequenced from 118 individuals in nine populations across the distributions of the pheasant. Forty-three variable sites defined 51 haplotypes. Sequence variation increased with increasing longitude (r = 0.725,P < 0.05) and annual average temperature (r = 0.833,P < 0.05). Neucleotide diversity increased with increasing longitude (r = 0.686, P < 0.05) and annual average temperature (r = 0.844, P < 0.05). Fragmentation and low temperature were factors that contribute to the decline of genetic diversity Sequence variation and Neucleotide diversity increased with decreasing variation coefficient of temperature (rsv = -0.679, P < 0.05; rvct = -0.669, P < 0.05). This shows that in more stable the temperature, higher genetic diversity of Strauch’s pheasant occurred.
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