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黄渤海海域口虾蛄野生资源的种群遗传学研究
Population Genetics of Oratosquilla oratoria in Bohai Sea and Yellow Sea
丁鸽1, 张代臻2*, 张华彬2, 赵玲玲1, 张蓓蓓1, 唐伯平2
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DOI:
作者单位:1. 盐城工学院化学与生物工程学院, 江苏盐城 224003;
2. 盐城师范学院, 江苏省滩涂生物资源与环境保护重点建设实验室, 江苏盐城 224051
中文关键字:口虾蛄;种群;遗传多样性;遗传分化
英文关键字:Oratosquilla oratoria; population; genetic diversity; genetic divergence
中文摘要:本研究通过扩增测序共获得了148条口虾蛄线粒体COⅠ基因序列,定义了52个单元型,其中存在63个变异位点。在黄渤海海域中,盐城口虾蛄种群的遗传多样性最高;渤海与黄海海域口虾蛄群体间遗传分化指数(Fst)为0.006 12。经MEGA 4.0软件计算得知11个种群间的遗传距离为0.0009~0.0057,而渤海与黄海两大海域间的遗传距离为0.0043。系统发生关系显示,渤海与黄海海域的单倍型呈交错聚集状态,说明两大海域间不存在显著的遗传分化。本次研究初步评估了两个海域的口虾蛄种群的遗传多样性水平,为渤海海域与黄海海域口虾蛄种质资源保护提供了基础资料。
英文摘要:148 COⅠ sequences of Oratosquilla oratoria were obtained by PCR in this study. A total of 52 haplotypes and 63 variable sites were identified in 580 sites of 148 sequences. Of all the 11 populations, the highest genetic diversity was observed in Yancheng population according to the average haplotype diversity and nucleotide diversity. And the genetic differentiation coefficient (Fst) between Bohai Sea and Yellow Sea was 0.006 12. The genetic distance among the 11 populations ranged from 0.0009 to 0.0057 as determined by MEGA 4.0 software. However, the average value of genetic distance between Bohai Sea and Yellow Sea was 0.0043. Phylogenetic tree showed that the 52 haplotypes were not clustered according to different populations, but overlapped with each other. In conclusion, there was no significant genetic differentiation between Bohai Sea and Yellow Sea. These results would be helpful for the conservation of germplasm resources of O. oratoria.
2015,34(4): 494-499 收稿日期:2014-12-22
DOI:10.11984/j.issn.1000-7083.2015.04.003
分类号:Q78;Q959.223
基金项目:国家自然科学基金项目(41301050); 江苏省基础研究计划(自然科学基金)资助项目(BK2011421); 江苏省高校自然科学基金重大项目(12KJA180009)和高层次人才项目(XKR2010003)
作者简介:丁鸽,女,博士研究生,研究方向:生物地理学研究
*通讯作者:张代臻,E-mail:zhangdzyc@126.com
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